Cílem strategie biohospodářství EU je připravit cestu pro inovativnější a konkurenceschopnější společnost, jež bude účinněji využívat zdroje a zajistí rovnováhu mezi zajišťováním potravin a udržitelným využíváním obnovitelných zdrojů k průmyslovým účelům a zároveň bude dbát na ochranu životního prostředí. Strategie a akční plán poskytnou informační základnu pro plány výzkumu a inovací v odvětvích biohospodářství a přispějí k vytváření soudržnějšího politického prostředí, k lepším vzájemným vztahům mezi politikami v oblasti biohospodářství na úrovni jednotlivých států, na úrovni EU a v celosvětovém měřítku a k prohloubení dialogu s veřejností. Mají vytvářet součinnost a zároveň respektovat doplňkové vztahy s jinými oblastmi politiky, nástroji a zdroji financování, jež s nimi sdílejí a řeší stejné cíle. Patří sem například společná zemědělská politika a společná rybářská politika, integrovaná námořní politika, jakož i environmentální a průmyslová politika a politika v oblasti zaměstnanosti, energetiky a zdraví.